L’opération consiste à modifier la forme de la cornée en réalisant une ablation localisée du tissu cornéen. Cette intervention s’effectue sous anesthésie locale, elle est réalisée par instillation de collyre juste avant le traitement par laser. Une fois l’œil anesthésié à l’aide de gouttes, le chirurgien pose un petit écarteur à paupières pour empêcher le patient de cligner de l’œil durant l’opération. Il gratte ensuite l’épithélium de surface à l’aide d’une spatule pour mettre le stroma à nu. C’est sur cette couche que doit agir le laser si l’on veut obtenir un effet réfractif durable. Cette étape est indolore et dure une à deux minutes. Le patient doit alors fixer une mire colorée située au-dessus de lui puis le laser Excimer est mis en marche. Le chirurgien entre les données (degré de myopie de la personne à opérer, éventuel astigmatisme associé, diamètre de la zone de traitement) puis c’est un ordinateur qui gère le temps d’application.